Utilizando Wine en mi portatil con Ubuntu tuve la necesidad de desinstalar un software que no necesitaba.

Buscando en internet me encontre con este post con el que pude solucionarlo:
Los paso a seguir son:

• Abrir una ventana
• Navegar hasta llegar a la carpeta
  ~/.local/share/applications/wine/Programs/
• Borre los archivos .desktop de las aplicaciones

Es posible que haya mas archivo dentro de subdirectorios
Tambien se puede realizar esta tarea usando el explorador.
.local es un subdirectorio de HOME y para verlo es necesario usar la combinación de tecja +h para hacerlo visible