puedes hacer los siguiente:
abre el terminal
para actualizar base de virus ejecuta
freshclam

para chequear archivos de la carpeta HOME ejecuta
clamscan

para chequear todos los archivos en el directorio HOME ejecuta
clamscan -r /home

para chequear todos los archivos del disco rigido ejecuta:
clamscan -r /

para chequear todos los archivos del disco pero mostrar solamente los que estan infectado emitiendo un sonido ejecuta:
clamscan -r --bell --mbox -i /

para forzar la actualizacion de la base de virus ejecuta:
sudo freshclam